En el IES Villajunco se ofertarán las siguientes especialidades y modalidades deportivas:

• La totalidad del ciclo inicial de grado medio en: Fútbol, Balonmano, Baloncesto y Atletismo. 
• La totalidad del ciclo final de grado medio en: Fútbol.

Enseñanza mixta, con bloque común en IES Villajunco y bloque específico en centro privado (federativo):

• El bloque común del ciclo inicial de grado medio en: Judo y defensa personal; Vela con aparejo fijo y aparejo libre.
• El bloque común del ciclo final de grado medio en:  Judo y defensa personal; Vela con aparejo fijo.

Para poder impartir los diferentes ciclos de las enseñanzas deportivas de régimen especial se requerirá un número mínimo de alumnos matriculados (ver resolución).

MODALIDADES DEPORTIVAS EN PERIODO TRANSITORIO

Enseñanza mixta, con bloque común en IES Villajunco y bloque específico en centro privado (federativo):

• Nivel I de: Surf, Natación, Kárate, Bádminton y Hockey.
• Nivel II de: Surf, Natación, Kárate, Bádminton y Hockey.