Para garantizar el buen funcionamiento y la mejora de la Educación en Cantabria existen una serie de Instituciones Educativas cuyo principal objetivo es trabajar sobre todas aquellas cuestiones que afecten al Sistema Educativo de Cantabria, dando una perspectiva constructiva ante los posibles problemas que en éste se generen: el Consejo Escolar de Cantabria y el Consejo Escolar de Formación Profesional.

Por otro lado, existen una gran cantidad de Asociaciones y Colectivos que, a través de diversas actividades y convenios colaboran con la Consejería de Educación en el desarrollo de programas educativos.